Kind: captions
Language: id
Hai assalamualaikum warahmatullahi
wabarakatuh di video Sebelumnya kita
telah mempelajari keberadaan ori sebagai
titik awal terjadinya peristiwa
replikasi DNA di video kali ini Mari
kita pelajari Bagaimana proses replikasi
DNA terjadi baik di prokariotik maupun
di eukariotik
Hai namun sebelum kita mempelajari
bagaimana proses replikasi DNA terjadi
Mari kita ingat sejenak bagaimana
struktur dasar dari DNA DNA yang
termasuk ke dalam asam nukleat terdiri
atas tiga komponen utama yang pertama
adalah gula ribosa lebih tepatnya
deoksiribosa karena dia kehilangan satu
oksigen
Hai gula deoksiribosa termasuk gula
pentosa karena dia terdiri atas lima
karbon-karbon pertama di sini karbon
kedua disini karbon ketiga disini karbon
keempat disini dan karbon kelima di sini
selain gula pentosa komponen selanjutnya
adalah gugus fosfat yang berikatan
dengan karbon nomor 5 dari gula tersebut
kemudian komponen selanjutnya adalah
basa nitrogen basa nitrogen DNA
kemungkinan ada empat macam bisa sitosin
bisa guanin bisa adenin ataupun timin
pada struktur yang tertera di slide ini
yang tertera adalah sitosin dan guanin
yang sama-sama basa nitrogen ini
berikatan dengan karbon nomor satu dari
gula pentosa di dalam DNA ini
Hai dan yang seperti kita ketahui DNA
itu biasanya unting ganda Meskipun tidak
selalu unting ganda
Hai dan setiap unting memiliki dua ujung
yaitu ujung 5 dan ujung tiga Kenapa ini
disebut ujung 5 karena atom yang paling
tinggi ratau paling ujung di sini adalah
atom nomor 5 ini ya atau nomor 5 yang
berikatan dengan gugus fosfat sedangkan
di ujung satunya atom yang paling luar
atau paling ujung adalah 3 dan ketika
berada di ujung atom karbon nomor tiga
ini berikatan dengan gugus Oh Ha
sehingga dikatakan sebagai ujung tiga Oh
bebas
Hai sehingga disini Bisakah kita katakan
denoting ganda selalu terdiri atas dua
ujung yang pertama ujung 5 yang kedua
adalah ujung 3 dan yang seperti kita
pelajari ketika DNA ini membentuk unting
ganda maka unting ganda tersebut
bersifat antiparalel
Hai unting yang pertama lima ketiga
sedangkan unting yang ke-23 kelima
jadinya misalkan di sini ujung 5 maka
untuk kedua disini ujungnya tiga kalau
disini ujung 3 maka unting pasangannya
ujung 5 saling berkebalikan arahnya
Hai dan ketika kita belajar
replikasi.dna kita nanti akan mengetahui
salah satu karakteristik dari sintesis
DNA sintesis DNA itu selalu terjadi dari
arah 5 ketiga sehingga di sini ada tanda
panah ya ini panah yang menunjukkan
perpanjangan rantai DNA ketika dia akan
bereplikasi arahnya selalu dari ujung 5
ketiga maksudnya adalah DNA baru
nukleotida baru ditambahkan selalu di
ujung tiga dari jadinya penambahan di
sini nanti kalau ada tambahan lagi
ditambahkan lagi di ujung tiga tidak
pernah ditambahkan di ujung 5 sehingga
gambarannya seperti ini ini ada
nukleotida baru nanti akan bergabung
untuk memperpanjang rantai DNA ini
bergabungnya adalah di ujung tiga Oh
bebas nanti dia akan berikatan dengan
gugus fosfat dari nukleotida yang baru
ini sehingga rantainya semakin memanjang
dan disini muncul
dakwah bebas lagi begitu ya Kenapa
karena DNA polimerase atau enzim yang
berperan mensintesis DNA itu salah satu
syaratnya adalah membutuhkan tiga Oh
bebas begitu ya enzim itu kan
membutuhkan substrat yang spesifik nah
salah satu substrak yang dibutuhkan oleh
enzim DNA polimerase adalah ujung tiga
Oh bebas sehingga dia hanya bisa
menambahkan DNA baru di ujung tiga Oh
bebas
Hai Nah kalau kita belajar di video
sebelumnya replikasi DNA itu selalu
terjadi di ori Titi awal terjadinya
replikasi dan ori yang paling terkenal
adalah Oryza Oryza itu dapat kita
temukan di bakteri ya dan di video
Sebelumnya kita telah mempelajari
karakteristik unik dari oryzae adalah
Dia memiliki dua daerah yang saling
Hai berulang
Oh ya Daerah pertama yang berulang
Panjangnya 13 pasangan basa berulang
tiga kali dan daerah kedua yang berulang
adalah yang perpanjangnya sembilan
pasangan basa dan berulang empat kali
Hai dan yang seperti ini kita singgung
di video sebelumnya kedua daerah itu
berperan ketika replikasi.dna dimulai
Hai yang pertama adalah ketika
replikasi.dna dimulai terjadinya Kaliori
terlebih dahulu nah daerah 9 pasang
basah yang berulang part kali ini
sebagai tempat pelekatan protein DNA
jadinya di ecoli di bakteri replikasi
DNA itu diawali dengan penempelan
protein DNA penempelan nya di daerah
yang panjangnya sembilan pasangan bahasa
ini yang berulang empat kali ini
kemudian DNA lainnya akan berkumpul
sehingga disini terdapat puluhan DNA
awalnya hanya empat kemudian diikuti
oleh DNA yang lain dan ketika sudah ada
puluhan DNA yang datang daerah ori ini
membengkok melingkar seperti ini begitu
ya Nah setelah melingkar seperti ini
daerah berulang satunya yang panjangnya
13 pasangan basa yang berulang tiga kali
ini mulai
buka untungnya kan ini melilit yang
oenting ganda ya Nah ini untuk gandanya
mulai dibuka di daerah yang tiga kali
pengulangan ini yang kalau di video
sebelumnya kita katakan di daerah ini
kayak ATM atau Rich
Hai setelah itu
Hai akan terbentuk replication Bubble
gelembung replikasi nah ketika membentuk
gelembung replikasi ini melibatkan enzim
DNA helikase inikan dna-nya double Helix
unting ganda istilahnya double Helix
yang membuka Double Helix ini nama
enzimnya adalah DNA helikase dan kalau
kita lihat disini ketika DNA ligase
datang ini diikuti oleh DNA C protein
DNA C jadinya protein DNA sini menempel
di DNA helikase nah ini proses yang
terjadi di awal replikasi diawali dengan
penempelan protein DNA a kemudian
diikuti oleh puluhan DNA yang lain
protein ya kemudian pembukaan di daerah
sini lalu diikuti oleh penempelan
protein enzim DNA ligase yang DNA ligase
tersebut juga ditempeli oleh protein DNA
Hai Nah setelah membentuk replication
Bubble ini gelembung replikasi ini maka
sintesis nukleotida akan terjadi Nah ini
kan sudah dibuka Dan kalau kita belajar
di model semikonservatif model yang
mampu menggambarkan proses terjadinya
DNA setiap unting ini akan menjadi
template akan menjadi cetakan untuk
hunting baru Nah sekarang kita ambil
salah satu lalu kita Letakkan di sini
ini kan ada dua ya kita ambil salah satu
Misalkan ini ujung tiganya ini ujung
limanya ini DNA yang baru dibuka
untungnya
Hai dan sekarang waktunya sintesis
nukleotida namun Seperti yang saya
singgung sebelumnya sintesis DNA itu
melibatkan DNA polimerase khususnya DNA
polimerase tiga itu nama enzimnya dan
enzim Ini Membutuhkan ujung tiga Oh
bebas permasalahannya ketika DNA ini
dibuka ini hanya menyediakan template
tetapi tidak ada ujung tiga Oh bebas
sehingga DNA polimerase tidak akan
menempel di daerah replication Babel ini
Hai untungnya berbeda dengan DNA Erna
itu dapat langsung disintesis tanpa
membutuhkan tiga Oh Bebas oleh karena
itu setiap sintesis DNA selalu diawali
oleh sintesis Erna segmen pendek
Nda sintesis MrNa segmen pendek ini
melibatkan enzim yang namanya primase
nah ini enzim lipase Enzim RNA primase
Ini fungsinya mensintesis Erna segmen
pendek dan erena segmen pendek ini
dikenal sebagai Erna Premier
Hai dengan demikian ya sintesis DNA
selalu diawali dengan sintesis RNA
primer terlebih dahulu kenapa untuk
menyediakan ujung tiga Oh bebas ini
Oh begitu softlens saya katakan tadi DNA
itu tidak bisa ujug-ujug langsung
mencintai segmen tanpa kepada untuk
ujung tiga wash di KWH bebas berbeda
dengan arena yang bisa langsung
mensintesis rantai tanpa keberadaan
ujung 13 sehingga sintesis DNA selalu
diawali dengan sintesis primer yang
merupakan Erna dan sintesis RNA primer
Ini Membutuhkan enzim primase
Hai nah kemudian ini semakin dapur
panjang ya ini diperpanjang sedikit
namun tidak terlalu panjang begitu
Hai nah itu yang terjadi ketika
replikasi bermula sekarang kita lihat
gambar disini ini merupakan struktur
dari DNA di bakteri bentuknya sirkuler
kemudian di sini ada titik ori titik
terjadinya replikasi pertama kali dan
kalau di ecole kita kenal ini sebagai
oryzae tadi tuh
Hai dan ketika replikasi terjadi
terbentuklah replication Bubble
gelembung replikasi dan gelembung
replikasi ini akan semakin membesar
seiring replikasi berjalan dan ingat
replikasi kebanyakan di bakteri dan ide
ekarion itu replikasinya bersifat dua
arah
Hai teorinya disini Namun replikasinya
kedua arah tekanan ori dan kekiri ori
kalau ini keatas dan kebawah dan kita
lihat setiap gelembung replikasi itu
selalu memiliki dua ujung dan dua ujung
ini kita kenal sebagai gelembung
replikasi sehingga kita katakan
replikasi itu bersifat dua arah ketika
ada ori kemudian anti replikasi akan
menuju kedua ujung garpu replikasinya
Nah karena gelembung replikasinya
semakin membesar maka garpu replikasi
nyanyi akan semakin
ia berjalan begitu ya Nah sekarang ini
tapi ada masalah seperti yang saya
sampaikan di awal tadi DNA untai ganda
itu kan selalu bersifat antiparalel
Hai yang satunya arahnya 53 satunya
arahnya 35 demikian pula pada DNA
sirkuler ini satunya arah 53 satunya
arah
Hai dan DNA kalau replikasi bersifat dua
arah sekarang saya ambil yang salah satu
ujung dari garpu replikasi ini saya
perbesar nah ini ya Ini templatenya
warna biru satunya ujungnya 5 ketiga
kemudian siang yang satunya ini ujungnya
tiga kelima jadinya Kok saling
antiparalel seperti ini ya kemudian
Anggap saja orinya disini di bagian sini
sehingga ketika terjadi replikasi DNA
akan membentuk
Hai penting
Hai nah jalannya seperti ini selalu ke
garpu replikasi Fred ya kearah kanan
semua ini namun permasalahannya adalah
Nah kalau yang dibawah ini betul arahnya
5 ketiga namun yang atas ini karena
templatenya 53 maka arahnya tipe ini
tiga kelima Badal Seperti yang saya
katakan tadi DNA Itu bisanya disintesis
dari arah 5 ketiga karena membutuhkan
tiga Oh bebas lah kok di bagian atas ini
Hai sintesisnya tiga
hai kenapa Apakah memang terjadi
kesalahan ternyata jawabannya tidak
Hai meskipun kelihatannya dua-duanya
menuju kearah kanan sehingga dikira
bayang bagian bawah ini 53 yang di
bagian atas ini tiga kelima sebetulnya
di bagian atas ini sintesisnya juga 53
juga namun sintesisnya segmen
pendek-pendek nah ini gambarnya
disintesis dulu 53 pendek kemudian
disintesis lagi 53 pendek disintesis
lagi 53 pendek sehingga disintesis
pendek-pendek namun arah keseluruhan
tetap kearah kanan sehingga kelihatannya
arah sintesisnya 35
Hai bingung sekarang Coba saya perbesar
bulunya
Hai yang bawah ini ya kan lancar tadi 5
ke-3 nah yang atas ini dia disintesis
dengan arah seperti ini nah tetap 5
ketiga tetapi pendek-pendek kemudian nah
disintesisnya berlanjut seperti ini 5353
terus bawahnya lagi 53 sehingga kalau
secara keseluruhan kelihatannya karena
saking cepatnya sintesis DNA
kelihatannya ke arahnya 35 nah
segmen-segmen PD ini dikenal sebagai
fragmen Okazaki gitu ya
Hai dan daerah dan unting di sini
dikenal sebagai unting legging friend
unting legging unting yang tertinggal
ketika replikasi.dna karena sintesisnya
pendek-pendek sedangkan yang di sini
namanya Leading strand Leading itu akan
memimpin begitu ya jadinya ketika kita
belajar replikasi.dna ada yang baru
permen berperan sebagai dinding Leading
ya ada yang berperan sebagai legging
laki-laki
Hai sintesis fragmen Okazaki itu terjadi
di legging friend laki-laki itu kan Agak
terlambat begitu kemudian disinikan
segmen pendek-pendek tadi yang
dihasilkan Naya segmen pendek segmen
pendek segmen pendek sehingga di sini
ada celah nah celah ini nanti
dihubungkan oleh enzim yang namanya DNA
ligase sehingga celahnya hilang
Hai nah ini ya tiga Takan disini
melibatkan DNA ligase Gambaran
sederhananya seperti ini ini defragment
Okazaki pertama fragmen Okazaki kedua
disini masih ada celah kemudian nanti
ini akan ditempel oleh DNA ligase
sehingga nanti sempurna nanti tidak ada
celah seperti ini begitu
Hai nah sekarang yang menjadi pertanyaan
adalah seperti saya katakan tadi setiap
sintesis DNA itu selalu membutuhkan
primer karena DNA tidak bisa langsung
disintesis dia butuh 3 Oh Bebas Karena
disini sintesis DNA nya berulang
pendek-pendek ya maka setiap sintesis
fragmen Okazaki Ini Membutuhkan primer
sendiri jadinya disini ada primer terus
membentuk fragmen Okazaki kemudian di
Sentra Primer present test DNA membentuk
fragmen Okazaki kedua di sini ada primer
sintesis ya kemudian membentuk fragmen
Okazaki ketiga baru nanti-nanti ditempel
oleh like share
Hai sehingga kalau kita perjelas
gambarnya seperti ini ini misalkan DNA
template nya
Hai kamu dan ini Anggap saja di-like
King friend maka di sini nanti akan
terbentuk fragmen-fragmen Okazaki
Hai nah sehingga di sini ada lebih dari
satu primer yang disintesis primernya
ini diberi warna hijau ya Nah primer ini
disintesis oleh DNA primase kemudian
setelah tiga terbentuk seperti ini
primernya sedikit memanjang setelah
primernya sedikit memanjang barulah DNA
polimerase tiga datang untuk melakukan
sintesis DNA
Hai Jadi mohon maaf ya misalkan Tadi
saya salah mengatakan Erna primase yang
betul itu Diana primase jadinya yang
mencintai sprime itu namanya DNA primase
kembali ke sini ya setelah primernya
diperpanjang kemudian DNA polimerase
datang untuk melanjutkan sintesis DNA
Hai karena disini sudah tersedia tiga Oh
bebas Nah sintesisnya selalu dari arah 5
ke-3 menjadi pertanyaan blog kita ini
sintesis DNA lah primer itu krna masa
hasilnya nanti untungnya selang-seling
DNA Irena nah jawabannya adalah primer
ini nanti dihilangkan Neng berperan
menghapus primer adalah DNA polimerase
Hai jadinya DNA polimerase tiga
fungsinya mensintesis DNA sedangkan DNA
polimerase satu fungsinya menghilangkan
primer Nah menghilangkannya dari
belakang sini
Oh ya jadinya dia nanti datang ke sini
nah primernya dihilangkan sedikit demi
sedikit nah sehingga Erna primernya
habis lalu disini masih ada celah-celah
ini lah nanti yang akan ditempel oleh
DNA ligase sehingga DC membentuk unting
baru yang semuanya terdiri atas DNA dan
tanpa celah begitu dan seperti
tersinggung tadi ketika replikasi
dimulai akan melibatkan DNA helikase
untuk membuka unting ganda membuka
Double Helix nya Nah peristiwa pembukaan
ini membutuhkan ATP sebagai sumber
energinya dan
Hai namun
Hai selain DNA jadi kaset ketika unting
gandanya dibuka maka DNA juga
membutuhkan protein yang dinamakan SSB
SSB itu single spring break protein ini
berperan melekat ke unting yang baru
dibuka ini kenapa kok hunting yang baru
terbuka ini harus ditempeli protein SSB
agar tidak membentuk airpin seperti ini
seperti yang kita ketahui unting DN
adukan tersusun atas basa nitrogen
aat-tgg-ccg-gct-agc sebagainya dan
adengan t itu kan komplemen jadinya dia
bisa berikatan membentuk dua ikatan
hidrogen guanin dan sitosin juga dapat
berikatan secara alami membentuk tiga
ikatan hidrogen Nah misalkan di sini ada
daerah atau kemudian di sini ada daerah
t makan nanti dia bisa berinteraksi
sehingga oentingnya akan membentuk
belokan belokan seperti ini kemudian
daerah ada ini disini berikatan dengan
time
ini misalkan di sini ada guanin
berikatan dengan sitosin nah bentukan
seperti ini dikenal sebagai hairpin atau
bentukan struktur ikat rambut karena
seperti ikat rambut wanita begitu ya
agar tidak terbentuk hairpin membutuhkan
protein SSB agar basah-basah nitrogen
yang komplementer disini tidak saling
melekuk dan berikatan
Hai nah selain protein SSB replikasi DNA
juga membutuhkan protein atau enzim yang
ditekan Al sebagai topoisomerase i
Hai seperti yang kita pelajari ya DNA
pada bakteri itu kan bentuknya sirkuler
dan ini kan melilit eh Mohon maaf ini
kan apa unting ganda double Helix saling
melilit seperti ini Dan seperti kita
pelajari tadi ketika replikasi terjadi
terbentuklah gelembung replikasi Nah
sekarang bayangkan kita mempunyai tali
seperti ini sirkuler kemudian salah satu
lilitan ini kita perbesar kalau lilitan
ini kita berbesar maka di daerah sini
akan bulet seperti ini Nah membulatnya
ini apa ya istilahnya ruwetnya seperti
ini dikenal sebagai positif superkoil
agar tidak terbentuk positif superkoil
maka ketika sebelum replikasi maka ini
harus diputar
Oh ya harus diputus terlebih dahulu
salah satu untungnya kemudian diputar
360° selama beberapa kali agar tidak
terbentuk ruwet seperti ini nah enzim
yang berperan memutar DNA agar tidak
terbentuk Positif superkoil itu adalah
topoisomerase secara umum topoisomerase
itu ada dua macam topoisomerase satu dan
topoisomerase dua bedanya secara umum
adalah kalau topoisomerase satu itu
hanya memotong satu unting DNA kemudian
memutarkan DNA tersebut Sedangkan
topoisomerase dua memotong dua unting
DNA itu beda sederhana antara isomerase
satu dan isomerase
Hai sehingga di sini ya selain helikase
selain primase selain protein SSB ketika
replikasi juga membutuhkan topoisomerase
sehingga kalau secara sederhana
digambarkan seperti ini
hai ketika DNA direplikasi unting
gandanya dibuka Siapakah yang membuka
yang membuka adalah helikase helikase
yang sudah ditempeli oleh ini DNA BAB
Hai ideapad n-ace kita lihat agar tidak
salah
Hai Oke sebentar ya
ndak di sini ya Nah DNA betul nama lain
dari DNA heliks DNA B ini ditempeli oleh
denace sekarang kita kembali ke
ringkasan gambar struktur replikasi.dna
tadi Nah di sini ya yang membuka unting
ganda adalah denah jika saat autec nabi
itu protein ya namanya protein HP nama
lainnya helikase DNA Benny ketempelan
DNA C sehingga namanya Kompleks DNA BD
nasi protein
Hai kemudian selain helikase yang
ketempelan denace pada replikasi DNA
juga melibatkan primase DNA primase yang
mensintesis primer primer ini adalah
segmen arena yang akan mengawali
peristiwa sintesis DNA sintesis DNA
sendiri membutuhkan DNA polimerase tiga
kemudian setelah replikasi terjadi Erna
ini segmen primer ini harus dibuang yang
membuang adalah DNA polimerase satu
setelah primer dibuang maka sisanya
hanyalah DNA Ini contohnya disini disini
awalnya ada primer kemudian primernya
sudah dibuang oleh polimerase satu
sedangkan yang ini masih proses
pembuangan sedangkan yang ini masih baru
proses sintesis DNA masih belum selesai
ini masih berjalan sintesis DNA nya Nah
setelah primer dibuang makhluk maka ada
celah-celah ini nanti akan ditempel oleh
ligase
Hai Nah di sini dikenal sebagai Leading
strand gile kingsland ini terbentuk
segmen-segmen fragmen Okazaki sehingga
primernya yang dibutuhkan juga banyak di
sisi lain di salah satu unting
sintesisnya 5 ketiga dan tidak terbentuk
fragmen Okazaki nah trend disini untuk
disini dikenal sebagai Leading strand
selain protein protein enzim-enzim yang
terlibat disini kita juga melibatkan
topoisomerase sehingga tidak terbentuk
superkoil
Oh begitu ya
Hai nah seperti yang kita pelajari ini
merupakan gambaran dari peristiwa
replikasi pada prokariot ingat ya
prokariot itu dna-nya berbentuk sirkuler
kemudian di sini ada ori origin of
replication tempat sintesis rap DN atau
replikasi DNA dimulai kemudian ini kita
lihat gelembung replikasinya semakin
membesar dan tentunya replication foxnya
ujung replikasinya berjalan terus
sehingga akhirnya DNA sirkuler ini
membentuk dua molekul baru
Hai yang bisa kita lihat satu DNA
sirkuler milik bakteri itu hanya
memiliki satu ori nah di sisi kanan ini
merupakan skema dari DNA milik eukariot
ingat ya kromosom di inti sel eukariot
itu bentuknya linier dan di sini bisa
kita lihat ternyata pembeda pertama
antara replikasi di eukariot dan
prokariot adalah kalau di prokariot
orinya cuma satu hanya satu sedangkan
pada eukariot khususnya di kromosom di
inti selnya ori di satu kromosom itu
bisa lebih dari satu bisa banyak ya ini
yang digambarkan hanya
Hai Jadinya kalau kromosom bakteri hanya
satu ori per satu kromosom sedangkan di
kromosom inti sel pada eukariot ori
dalam satu kromosom bisa lebih dari satu
bisa banyak
Hai Selain itu bedanya juga kalau pada
eukariot kita juga mengenal keberadaan
nukleosom
Ayo kita ingat ya jadinya di berkromosom
inti sel eukariot DNA itu meliliti
histon nah event yang dililiti oleh Deni
kita kenal sebagai nucleosome
Hai nah ketika replikasi terjadi
nukleosom itu harus dibongkar setelah
reboot setelah dibongkar setelah
membentuk unting baru nukleosom baru
harus dibentuk lagi sehingga laju
replikasi batil Karyo tentunya lebih
lambat daripada prokariot
Oh begitu ya laju reaksi laju sintesis
DNA nya lebih lambat Kenapa karena badai
eukariot juga melibatkan pembongkaran
dan pembentukan nukleosom baru di sini
bisa kita lihat pembentukan nukleosom
baru ini melibatkan beberapa
protein-protein pertama adalah nukleosom
assembly protein yang disingkat sebagai
map on NAV1 yang fungsinya membawa
protein histon dari sitoplasma ke
Hai setelah sampai ke inti sel maka
Houston ini akan dibawa oleh kromatin
assembly faktor 1/1 yang nanti akan
dibawa ke sini
Hai dan akan menempel di protein yang
namanya pcna Nah bsni nanti yang akan
terlibat dalam penyusunan nukleosom
Oh begitu ya Nah itu penjelasan terkait
proses replikasi DNA pada eukariot dan
procount chord prokariot Mohon maaf
terima kasih atas perhatiannya pada
video selanjutnya Mari kita pelajari
proses transkripsi Mohon maaf bila ada
kesalahan Assalamualaikum warahmatullahi
wabarakatuh