Transcript
YWeFFFwGxLE • Penyiapan Struktur dan Analisis Potensi Senyawa Alami sebagai Kandidat Obat secara Bioinformatika
/home/itcorpmy/itcorp.my.id/harry/yt_channel/out/EnsiklopediaAhmadFauzi/.shards/text-0001.zst#text/0225_YWeFFFwGxLE.txt
Kind: captions
Language: id
Halo assalamualaikum warahmatullahi
wabarokatuh berjumpa lagi dengan saya di
channel YouTube saya ensiklopedia Ahmad
Fauzi di video kali ini dan di beberapa
video ke depan kita akan mempelajari
bagaimana caranya melakukan analisis
biofarmasetika yang bertujuan mencari
senyawa alami yang mampu menjadi
kandidat obat penyakit tertentu dan pada
video kali ini Mari kita dalami
bagaimana caranya mencari struktur
senyawa alami dan mengkaji potensinya
sebagai kandidat obat dari penyakit
tertentu
Sekarang mari kita tentukan terlebih
dahulu senyawa alami yang ingin kita
jadikan contoh kasus
dalam menentukan senyawa alami ada
berbagai pendekatan ya misalkan kita
sudah kelebba sah kita sudah kelek
biologi kita punya penelitian sendiri
penelitian kita mengkaji zat X terhadap
penyakit y z x ini bisa kita jadikan
senyawa alam kita atau berdasarkan
penelitian peneliti lain peneliti lain
sedang meneliti adanya potensi senyawa X
yang mampu menjadi kandidat obat browser
penyakit y dan dikajinya melalui Le
basah nah senyawa tersebut bisa kita
angkat sebagai senyawa alami yang akan
kita teliti secara Informatika atau dari
pengetahuan masyarakat di masyarakat
mengenal dan mengetahui serta
mempercayai tanaman Tertentu bisa
mengobati penyakit tertentu nah tanaman
tersebut bisa kita cari senyawa aktifnya
apa saja nah senyawa aktif ini yang
kemudian kita angkat sebagai senyawa
alami yang akan kita analisis secara
Informatika misalkan saja di Indonesia
itu jahit terkenal sebagai obat dari
berbagai penyakit nah ini saja yang kita
angkat misalkan jahe sebagai antikanker
Nah kalau kita sudah menentukan jahe
sebagai tanaman yang akan kita analisis
maka kita harus mencari senyawa bioaktif
apa saja yang terkandung didalam Day
kita bisa Kalau basah ekstraksi sendiri
kemudian kita identifikasi sendiri
senyawa alami apa saja yang ada di jahit
tersebut Namun kalau kita tidak
memungkinkan melakukan hal tersebut kita
bisa juga menggunakan penelitian
terdahulu yang telah mengekstraksi
senyawa alami dari jahe misalkan ya
kandungan senyawa alami dari jahe ini
kita cari di Google kita cari
penelitian-penelitian yang sudah
mengekstraksi
kandungan senyawa alami dari jahe gitu
ya misalkan menggunakan kata kunci
seperti ini atau mungkin seperti ini
ekstraksi
senyawa alami dari jahe kemudian tinggal
kita download saja ya atau menggunakan
bahasa Inggris the list of you aktif
empon
from finger Misalkan seperti ini Ya udah
kita cari kemudian kita download kita
baca Hai misalkan dari artikel ini kita
lihat Apa saja bioactive compounds atau
senyawa bioaktif yang ada di dalam jahe
tinggal kita teliti kita baca hati-hati
Maka nanti akan ketemu berbagai senyawa
alami tersebut ya kemudian ini masih
proses Hani Bisa dicek sendiri ya nanti
kemungkinan ada senyawa yang namanya si
ngeberesin
kemudian misalkan kurkumin kemudian
Sogol ada gingerol dan sebagainya dari
berbagai senyawa aktif tersebut Coba
kita pilih salah satu dahulu misalkan
kurkumin jadinya kita ingin melakukan
penelitian secara Informatika Apakah
kurkumin memang mampu menjadi kandidat
obat kanker begitu setelah kita
menentukan Senyawa apa yang ingin kita
analisis langkah selanjutnya adalah kita
harus mencari struktur senyawa alami
tersebut untuk mencari atau mendapatkan
struktur senyawa alami Oke kita harus
the database nah database yang bisa kita
gunakan adalah camp ya di Google
kita bisa mengetikkan Pak camp kemudian
ini hasil pencariannya kemudian kita
pilih yang patcham dari McD ini ya ini
kita klik pakai m.jd.com rm.com ini
halamannya kemudian disini ada Kolom
pencarian kemudian nama senyawa alami
bisa kita tulis disini misalkan yang
tadi sudah kita tentukan curcumin
curcumin
kemudian kita enter setelah itu akan
muncul hasil pencarian ada banyak ya
kemudian biasanya di paling atas sini
ada best match nah ini saja yang kita
pilih ya kalau nggak muncul best Maps
Yaudah kita pilih yang paling pertama
begitu atau kita ingin mendownload
beberapa juga silahkan Nah sekarang Coba
kita pilih yang ini kita klik disini
maka kita akan diarahkan ke halaman yang
berisikan Detail informasi terkait hukum
ini nah ini ada macam-macam ada
informasi terkait kurkumin Nah tadi
fokus kita kenapa kita ingin ke Pak m
karena kita ingin mendownload subtour
dari kurkumin bagaimana caranya di sini
ada daftar isi ya Ada konten nah disini
nomor satu structure di sini ada tanda
panah ke bawah ini kita klik kemudian di
Point 1.2 ada 3D konformer 3D konformer
ini bisa kita klik kiri sekali maka kita
akan diarahkan kearah bawah ini Nah
inilah struktur tiga dimensi dari
kurkumin ini perlu kita download
Bagaimana cara downloadnya disini ada
menu ada tombol download ini kita klik
kemudian ada pilihan beberapa jenis file
format file kita pilih yang sdf kita
klik Steve
sehingga si kurkumin ini struktur Tiga
dimensinya sudah terdownload dalam
bentuk atau format PDF ini namanya
konformer Tri di Anda scores ID dan
seterusnya kita lihat ya di Windows
Explorer
namanya agak susah ini untuk memudahkan
kita kita bisa merinding nama dari file
ini misalkan namanya Kita sesuaikan
dengan nama senyawa yang kita cari
kurkumin jadinya seperti ini
kurkumin.pdf biar lebih mudah menamai
file ini Oke kemudian Selain Kita
men-download syukur tiga dimensi dalam
bentuk sdf kita juga perlu mencari
smashnya cemils
nah Apa itu Smash saja kita lihat Disini
di konten sebelah kanan ini ada name and
identifier ini tanda panah kebawah kita
klik kemudian disini
2.1.4 ada kanonikal smile ini kita klik
kiri sekali maka kita diarahkan ke menu
kanonikal Smash di sisi kiri Ini nah ini
adalah smiles dari senyawa kurkumin
hal ini perlu kita copy kontrol C
kemudian kita buka note Pep kemudian
kita bisa kita saling knotted kalau
memang perlu ngepet ini kita save juga
kemudian kita kasih nama Miles kurkumin
seperti itu Misalkan Tapi kalau nggak
mau di-save juga silakan tapi yang jelas
Smash dari kurkumin ini harus kita salin
dan harus kita simpan Kenapa karena
Smash ini akan digunakan sebagai dasar
analisis di langkah selanjutnya Oke
sekarang kita sudah mendapatkan syukur
kurkumin baik dalam format swf maupun
Smile nya Sekarang mari kita kaji Apakah
benar kurkumin berpotensi sebagai
antikanker untuk mengkaji potensi
tersebut kita harus ke webserver yang
namanya pas online kita bisa ke Google
kemudian kita tulis paste online seperti
ini
setelah hasil pencarian muncul pilih
online yang dari website gue itu
drag.com jangan yang pas online.co.id
yang waktu Dragon kita klik sehingga
kita akan diarahkan ke halaman semacam
ini
langkah selanjutnya di sini ada Ghofur
prediction Oh ya Sebelum saya lanjut
terkadang website ini tidak bisa diakses
oleh beberapa operator ya Ketika saya
menggunakan Indosat kadang pas online
tidak bisa diakses namun ketika saya
menggunakan Telkomsel atau menggunakan
wifi dari kampus malah bisa begitu
jadinya bagi Anda yang tidak bisa
mengakses pasonline coba gunakan
operator lain atau nunut Wifi dari orang
lain atau dari kampus Anda
ini website online dari white kemudian
di sini ada tombol go proprediction
dibawah tulisan online ini kita klik
setelah kita klik akan muncul pop up
seperti ini kalau kita belum punya akun
di whitelight maka kita harus registrasi
terlebih dahulu maka di tombol
registration ini kita klik kiri sekali
lalu kita tulis biodata kita disini
emailnya kita tulis kemudian nama awal
misalkan Ahmad nama akhir Fauzi
kemudian
position misalkan melek er atau kalau
anda mahasiswa bisa ditulis student
company a a bisa nama kampus kita
Universitas Muhammadiyah Malang misalkan
kemudian jalan tidak perlu diisi Siti
harus kisi-kisi nama kota kita malah
misalkan provinsinya tidak harus
discordnya tidak harus santrinya harus
dipilih saya di Indonesia kemudian
bidang kita atau bidang yang tertarik
Nah misalkan B Informatika jadinya ini
tanda panah ini kita klik kemudian kita
pilih salah satu kita klik kiri lagi
kemudian di sini ada tombol F ini kita
klik kemudian email harus diisi lagi
kemudian kita kasih nama Hai akun yang
ingin kita gunakan sebagai akun kita
Dewi Putra misalkan Fauzi 91 kemudian
disini ada keterangan ya tidak boleh
kurang dari empat Karakter nama lebih
menjeda kemudian m not robot ini
dicentang Lalu nanti diklik Eye Cream
Saya tidak klik airbrush saat ini karena
saya sebetulnya sudah punya akun b Nanti
anda kalau sudah ia beri maka registrasi
anda sudah selesai
setelah registrasi selesai kita kembali
ke halaman utama website
Nah sekarang kita kembali lagi ke tombol
Bop rekor prediction ini kita klik
kemudian kita isi lagi Ndan password
kita loh passwordnya dari mana kita bisa
cek Imel kita kalau registrasinya Brazil
makan nanti kita akan memperolehi email
dari waktu yang berisikan di user atau
login here password kita misalkan di
email saya di sini ada Imelda riwettu
drag kemudian title emailnya white udah
registration data kalau kita buka email
ini akan ada nama username kita kemudian
ada password kita ini yang kita Isikan
di pop ini nama user saya Fauzi 91
kemudian disini passwordnya tinggal kita
copy saja kita Salin di sini kemudian
enter
setelah itu website kita tampilannya
seperti ini website online lalu kita
klik predictio komponen setelah itu akan
ada tombol Smash ini kita klik Lalu ada
kolom tempat smiles bisa kita Letakkan
kita bisa kembali ke frame lagi kita
copies mereknya atau yang tadi Dino Pet
itu ya Innova itu bisa kita gunakan
untuk Hai nah ini saya copy lagi
Kemudian saya Letakkan di sini saya
salin kemudian klik get prediction
setelah kita klik get prediction kita
bisa Scroll ke arah bawah nah ini
hasil-hasil Prediksi potensi dari
kurkumin di sini ada list aktivitas
biologis yang diprediksi melibatkan
kurkumin atau dalam artian lain kurkumin
diprediksi dapat terlibat dari berbagai
aktivitas geologis ini kemudian ini ada
PR dan
pipit8174 IV pada berbagai aktivitas
biologis ini sedangkan paid to
probability in active kemungkinan si
kurkumin menjadi inaktif di berbagai
aktivitasnya Nah tadi dibuat ISIS kita
hipotesis awal kita senyawa kurkumin
dapat berpotensi sebagai cone kandidat
obat kanker maka karena ini aktivitas
biologisnya banyak kita bisa paint bisa
menggunakan control of your untuk
mencari kata-kata kunci terbaik kanker
dari licin Kalau Anda mengangkat
penyakitnya osteoporosis maka anda coba
cari katakunci kata kunci yang berkaitan
dengan Osteoporosis bisa dari nama Enzim
yang terlibat atau alur metabolisme yang
terlibat atau fenomena biologis yang
pribadi osteoporosis kalau hebat ISIS
juga seperti itu jadinya tergantung
penyakitnya coba phyllis katakunci nya
lalu kita fine bisik contohnya tadi ya
misalkan kita kanker maka saya bisa Klik
control FT di keyboard maka disini akan
muncul kotak paint ya misalkan kanker
kata kunci pertama yang berkaitan erat
dengan kanker yaitu bahasa Inggrisnya
center Nah di sini ada prostate Cancer
treatment nah Sebelum saya membahas ini
mumpung saya ingat di sini ada pea lebih
besar dari Tipe lebih bisa dari 0,3
validasi tinggal koma tujuh Maksudnya
apa kalau pea lebih besar dari 0,3 maka
secara LED kering secara in silico
senyawa yang kita analisis terbukti
terlibat di berbagai aktivitas ini
sedangkan kalau PH lebih dari 0,7
artinya sudah dicopykan bahwa senyawa
tersebut secara lebih basah terlibat
dari berbagai aktivitas ini nah pea ini
bisa kita lihat ini baiknya kita bisa
memfilter kita cuma ingin peta yang
lebih besar dari by tinggal diklik
kemudian klik ok atau Saya ingin mencari
aktivitas biologis yang bisa melibatkan
kurkumin namun sudah terbukti secara in
silico maka kita pilih pea lebih besar
dari 0,3 atau kita sempitkan lagi saya
hanya ingin mencari potensi kurkumin
terlibat dari berbagai aktivitas yang
sudah dibuktikan secara lebih basah maka
kita pilih Pea yang 0,7 BGT ya kemudian
jangan lupa diklik oke oke kembali lagi
tadi kita menekankan nya kata kunci
Cancer langsung saya klik nah ini
prostat Cancer treatment ph-nya 0,54
jadinya secara in silico
senyawa kurkumin memang berpotensi
terlibat sebagai treatment dari kanker
kanker prostat kemudian di sini ada
antineoplastik neoplastik itu semacam
jaringan yang pembelahan selnya tidak
terkendali antineoplastik breast Cancer
ph-nya 0,58 jadinya kurkumin berpotensi
secara in silico memang pribadi dalam
penekanan breast Cancer kemudian saya
cari lagi menggunakan kata kunci Cancer
yang selanjutnya antineoplastik lagi
tapi pada lung queensland belum Cancer
apa kanker paru-paru Kanker paru-paru
lagi Kemudian ini serviks kanker serviks
juga sebagai antineoplastik tapi
probability aktifnya hanya 0,3 23 ya
kemudian ini lebih rendah lagi 0,2 13
dia terlibat sebagai
Hai editor dari fresh Cancer resisten
protein kita bisa menggunakan kata kunci
lain yang berkaitan dengan kanker
misalkan karsinoma karsinoma Tetris
Karachi atau karsinogen jadinya kanker
itu biasanya ada istilah
karsinoma
antineoplastik karsinoma tapi hanya
kecil sekali yang lain itu juga kecil
nah ini lumayan besar antikarsinogenik
antikarsinogenik karsinogen itu ya
kanker itu sendiri karsinogenesis itu
pembentukan sel tumor atau kanker
jadinya antikarsinogenik itu semacam
penekanan pembelahan sel kanker Oke
Jadinya kalau berdasarkan pas online
dari website
memang kurkumin ini berpotensi sebagai
senyawa yang mampu menjadi kandidat obat
kanker Kenapa karena berdasarkan nulis
aktivitas biologis ini Hai ternyata
kurkumin terhebat tadi sebagai
antineoplastik terlibat sebagai
antikarsinogen ribet sebagai yang
lainnya begitu namun ini masih tahapan
awal dari analisis gempar matikah dalam
pencarian kandidat obat sebagai senyawa
alami penyakit senyawa alami kandidat
obat penyakit tertentu ya ini masih
kajian potensi Nah langkah selanjutnya
adalah kita harus mencari protein target
protein target dari kurkumin kemudian
kita lihat analisisnya kita lihat
interaksinya apakah benar kurkumin ini
bisa berikatan dengan protein target
yang terlibat dalam pembentukan kanker
atau Pulau penyakit lain misalkan
osteoporosis yang anda angkat Apakah
benar senyawa alami yang Anda pilih itu
dapat berinteraksi dengan protein
protein yang terlibat dalam
kemunculan senyawa osteoporosis maka
langkah selanjutnya setelah kita
mengkaji potensi senyawa alami
menggunakan pas online di selanjutnya
adalah kita mengidentifikasi
protein-protein target yang bisa menjadi
target senyawa alami telah kita pilih
namun bagaimana cara mencari protein
target tersebut akan kita bahas di video
selanjutnya saya akhiri video kali ini
terima kasih assalamualaikum
warahmatullahi wabarakatuh